您好，欢迎來到青莲百(bai)奥(ao)!
宏基因組學（Metagenomics）又名元基因組，鳥枪法(fa)宏基(ji)因組測序，繞(rao)過對微生物個體進行分离培养，應(ying)用基因組學技術對環境中全部微生物的(de)群落組成及群落功能進行研究。
宏基因組學測序技術作(zuo)為(wei)一種高通量分析手段，能够直接从環境樣品中获取微生物體系的群落組成信息，深入揭(jie)示(shi)微生物與宿主之間的相互作用機製，同(tong)時获得难以通過常規分离培养获得的(de)菌株基因組序列，並可評估不同處理条件(jian)對物種豐度和(he)基
深入探(tan)索微生物菌群的(de)群落結構、代谢功能及(ji)其與(yu)代谢性疾病的關聯機製，通過采集和(he)分析粪(fen)便樣本、肠道内容物、胃内容物以(yi)及(ji)口腔微生物等多個部位的微生態数據，揭示菌(jun)群
不同營养状態(tai)或免疫水平下微生物物種和功能(neng)差异（瘤胃液、肠道内容物、粪便）
可再生生物(wu)资源里微生物組成及功能(neng)（活性(xing)污泥、深(shen)海樣本等）
不同地域和氣(qi)候下微生物物種和功能差异（土壤、根系(xi)、根(gen)内生菌等(deng)）
发酵工(gong)程種微生物群(qun)落和功能发生的變化（酒(jiu)糟、酸奶(nai)、培养菌群等）
環境(jing)治理過(guo)程中微生物的變化（污水(shui)、污泥、淤泥等）
百余種不同環境樣品(pin)的微生(sheng)物檢測與分析服務，涵盖動(dong)物源樣品如粪便、肠道内容物、饲(si)料、长粘膜、瘤胃液，微生物发酵相關樣品如酒曲(qu)、发酵液(ye)，以及土壤、植物内生菌
针對不(bu)同樣本類型，采用(yong)不同的提(ti)取方法，使用illumina原裝進口建库(ku)試剂盒(he)
定量嚴格，数(shu)據產出均一性優(you)
①基礎分析
②常規分析：物種(zhong)組成、Alpha和Beta多樣性分析、基因预測(ce)及功能注释(shi)、功能注释豐度分(fen)析(xi)、物種注释豐度分析
③高級分析：宏(hong)基因組關键生物(wu)標志物筛選
④個性化分析：VFDB病(bing)原菌毒力因(yin)子注释、ARDB耐药(yao)基因注(zhu)释、CARD抗性(xing)基因注(zhu)释等（宏基(ji)因組）
发表期刊：Cell Host Microbe
影響因子：20.6
发表單位：海交通(tong)大學医學院附屬瑞金医院
发表時間：2024.07.11
| 樣本類型 | 16S rRNA | 宏基因組 |
| 粪便 | 0.5g | 1g |
| 肠道内容物 | 0.5g | 1g |
| 肠道組織 | 1g | 2g |
| 唾液 | 2-4mL | 5-10mL |
| 生殖道樣本 | 刮片3片 棉拭子 3份 |
刮片3片 棉拭子 3份 |
| 固體類食品 | 60g | 60g |
| 液體類食品 | 50mL | 50mL |
| 土壤 | 2-5g | 2-5g |
| 植物内生菌 | ≥20個贴片、卷片組織 ≥1.5g石蜡块 |
≥20個贴片、卷片組織 ≥1.5g石蜡块 |
| 水樣滤膜 | 直径3-5cm，3-5张 | 直径3-5cm，3-5张 |
