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項目文章(IF 13.0)| 武漢大學储昭輝成果:磷酸化修飾揭示銅离子誘导植物免疫的分子機製

自1885年(nian)波爾多液問世以來,銅基杀菌剂(CBACs)在農(nong)業(ye)上應用已超過130年。傳統觀點認為其(qi)作用仅(jin)仅是“物理屏障”和“直接杀(sha)菌”。然而,近期武漢大學储昭輝教授團(tuan)隊在Journal of Advanced Research(IF=13.0)上发表了題為“The CPK3-mediated cytosolic–nuclear translocation of bHLH107 recruits HY5 to regulate the Cu2+-triggered upregulation of ACS8”的研究论文,揭示(shi)了一個惊人的(de)事實:低浓度的銅离子本身就能(neng)作(zuo)為信號,通過磷酸化修(xiu)飾触发植(zhi)物自身強大的免疫防御系統。今(jin)天,我們(men)將深入解析这(zhe)一研究,探討 Cu2+ 如(ru)何通過(guo) CPK3-bHLH107-HY5-ACS8 这一核心模块,實現从离子信(xin)號到抗病能力的跨越。

北京青莲百奥生物科技有(you)限公司為文章提(ti)供了磷酸化修飾檢測服務。

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研究背景交代

  • 銅是植物生(sheng)长必需的微量元素,但(dan)過量則產生毒(du)性。在植物病害防治中,低浓度的銅(tong)离子(zi)(低於 200 μM)並不能直接抑製細菌(jun)的生长,但(dan)卻能顯著(zhu)增強植物的抗病性。

  • 已知乙烯合成限速酶基因 ACS8 的表達上調是銅(tong)誘导免(mian)疫的關键,且(qie)其启動子區域存在銅響應元件(CuRE)。但問題在於:谁感知了銅(tong)信號?谁(shui)將信號从胞質傳(chuan)导至核内?谁最終開启了轉錄大門?

樣本與技術流程

實驗模型:

以擬南芥(Arabidopsis thaliana)為(wei)核心模(mo)型,涵盖了野生型(Col-0)、多種 T-DNA 插入突變體(bhlh107、cpk3、hy5、acs8)以及基(ji)因回补(bu)株系。

技術:

  • 磷酸化修飾組學 & 轉錄組學:筛選銅響應的關键蛋(dan)白及修飾。

  • DNA Pull-down質谱:捕获與 ACS8 启(qi)動子結合的轉錄因子。

  • 互作驗證:酵(jiao)母單(dan)雜交(Y1H)、雙(shuang)分子(zi)荧光互补(BiFC)、免(mian)疫共沉淀(Co-IP)和體外(wai) Pull-down。

  • 功能驗證:ChIP-qPCR、EMSA、定點突變、亚細胞定位(wei)觀察。

研究結果

1. 核心轉錄因子的锁定:bHLH107

研究首先通過(guo)遗傳學實驗證(zheng)明,删(shan)除(chu)ACS8启動子中的CuRE元件,會完全消除(chu)銅离子誘导(dao)的ACS8表達(da)和對病原菌Pst DC3000的抗性(圖1A, B),證實CuRE是必不可少的。随后,通過DNA pull-down和質(zhi)谱分析,从候選蛋白中筛選出bHLH107,並通(tong)過電(dian)泳遷移率變動分析和染色質免疫共沉淀實驗,分別在體外和體内(nei)證實(shi)bHLH107能够直接、特异地結合(he)到(dao)CuRE序列上,且这種結合(he)在銅离子處理后顯著增(zeng)強(圖1C, G)。初步(bu)的荧光(guang)素酶報告基因實驗也顯示bHLH107能激活由CuRE驅動的(de)報告基因表達(da)。

1776145705417897.png圖1. bHLH107 直接(jie)結(jie)合 ACS8 启動子中的 CuRE 順式作用元(yuan)件(jian)

2. bHLH107正向調控銅离子触发的(de)免(mian)疫反應

利用兩個T-DNA插入突變體(bhlh107-1, bhlh107-2)和一個CRISPR基因编輯突變體(bhlh107),研究(jiu)人員发現,这些突變體(ti)中銅离子誘导的ACS8表(biao)達顯(xian)著减弱(圖2B, E),對Pst DC3000的抗性(xing)也明顯(xian)下降(圖2C, F)。而(er)將完整(zheng)的bHLH107基因回补到突變體(ti)中,則(ze)可以恢复这些功(gong)能(圖2B, C)。这(zhe)直接(jie)證明bHLH107是銅离子触发免疫所必(bi)需的。此外,轉錄組分析表明,bhlh107突變导致大(da)量(liang)銅离子誘导的防御相關基因(如植物-病原互(hu)作(zuo)、激素信號轉导通路基因)表(biao)達受阻(圖2H-K),進(jin)一步从全基因(yin)組水平證實了bHLH107的核心(xin)調控作用。

1776145744738667.png圖2. bHLH107 正向調(diao)控擬南芥(jie)中由 Cu2+ 触发的免疫反應

3. 銅离子刺激bHLH107发生磷酸化並向細胞核(he)轉移

虽然bHLH107的轉錄本水平受銅誘导,但仅仅過表達bHLH107並不能(neng)完全(quan)模擬銅离子的免疫增強效果(圖3A-C),这表明存在轉錄后調控。細胞組分分(fen)离實驗和荧光共聚焦顯微镜(jing)觀察顯示,在正常(chang)情(qing)况下,bHLH107蛋白分布於細胞質和細胞核;而銅离(li)子(zi)處理后,bHLH107快速(su)从細胞質向細胞核富(fu)集(圖3D, E)。同時,Phos-tag凝(ning)胶電泳檢測到銅离子處理增加了bHLH107的磷酸化水平(圖3F),提示磷酸化可(ke)能(neng)驅動了其核定位變化。

1776145774700675.png圖3.Cu2+刺激 bHLH107 发生磷酸化並向細胞(bao)核轉(zhuan)位

4. 钙依赖蛋白激酶CPK3磷酸化bHLH107,介(jie)导其核轉(zhuan)位

通過磷酸化蛋白(bai)質組(zu)學和IP/MS分析,研究團隊將目光锁定在钙离子傳感器CPK3上(圖4A)。實驗證實CPK3與bHLH107存在物理互作(圖4C-E),且cpk3突變體(ti)同樣表(biao)現出銅离子誘导的ACS8表達和抗病性缺陷(圖4F-H)。

  • 磷酸化位點鉴定驗證:體外激酶實驗和LC-MS/MS分析確定(ding),CPK3能够磷酸化bHLH107的第62位(wei)和第72位(wei)丝氨酸(圖5A-E),圖5C給出了Ser72磷酸化肽段的質谱二級谱圖作為(wei)修飾存在的直(zhi)接證據。

  • 功能驗證:將这兩個位點突變為模擬磷酸化的天冬氨酸(suan)(S62/72D)后,bHLH107主要定位於細胞核(he),並能持續激活下游(you)報告基(ji)因和增強抗病性;反之,突變為无法磷(lin)酸(suan)化的丙氨酸(S62/72A)后,bHLH107則滞留在細胞質,且其轉錄活(huo)性和(he)介导的抗病性顯著降低(圖5F-J)。

  • 依赖關系:CPK3突變體背景下,銅离子无法誘导bHLH107的核积累(lei)(圖5K, L)。这(zhe)些(xie)結果共同證明,CPK3通過磷酸化(hua)bHLH107的Ser62和Ser72,驅動其从細(xi)胞質向細胞核(he)轉運,从而激活其(qi)轉錄功(gong)能,是銅信(xin)號傳遞中(zhong)的關键步骤。

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圖4. CPK3與bHLH107相互(hu)作(zuo)用並參與Cu2+触(chu)发的免疫

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圖5. CPK3 磷酸化 bHLH107 的Ser62/72,促進其(qi)核积累和轉錄激活功能(neng)

5. 轉錄因(yin)子HY5作為bHLH107的共激活子,协同放大免疫信號

在細胞核内,bHLH107並非独自工作(zuo)。研究发現(xian)它與光信號核心轉錄因子HY5相互作用(圖6A-D)。HY5功能缺失突變體(ks50)對(dui)銅离子誘导的抗病性减弱(圖6F)。結(jie)合機製為HY5不(bu)結合CuRE,而是直接結合(he)在ACS8启動子(zi)上(shang)的ACGT元件(圖6I-L)。而且,在HY5缺(que)失的背景下(xia),即使過(guo)表達bHLH107,其與CuRE的結(jie)合能力也大幅下降(jiang)(圖6M)。这表明,HY5作為bHLH107的“共激活子”,通過(guo)直(zhi)接結合鄰近的DNA位點,稳定(ding)並增強了(le)bHLH107與CuRE的(de)結合,从而(er)协(xie)同放大ACS8的轉錄(lu)激活信號。

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圖6. HY5 與 bHLH107 发生物理相互(hu)作用並參與Cu2+誘(you)导的(de)防御反應

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圖7. 总結:CPK3-bHLH107-HY5 模(mo)块調控(kong)Cu2+触发(fa)的植物免疫

总結

该研究構建了(le)一個完(wan)整的信號通路圖谱(圖7):

感應期:微量銅离子刺激(ji)导致細胞内钙离子信號波動,激活(huo) CPK3 激酶(mei);

傳导期:CPK3 磷酸化 bHLH107 的 Ser62/72 位點,驅動其从胞質進入細胞核;

執行期:進入核内的 bHLH107 招募 HY5,共同結合在 ACS8 启動(dong)子上;

效應期:乙(yi)烯合成基因大量表達(da),植物(wu)免疫(yi)系統全面“唤醒(xing)”,成功抵御病原(yuan)菌入侵。

青莲百奥合作文章

青莲百奥深度參(can)與衆多前沿研(yan)究,與中國医學科(ke)學(xue)院、中國科學院、军事医(yi)學研究院、國家蛋白質科(ke)學中心(xin)、四川大(da)學華西医(yi)院等顶尖科研機構通力合作,累計发表SCI论文近200篇,累計(ji)影響因子(IF)超1500。多項重磅研究成果发表(biao)於《Nature》《Science Translational Medicine》《Nature Communications等國际顶級期刊。

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