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全(quan)称Protein-protein interaction（蛋白質-蛋白質(zhi)相互作(zuo)用），是指(zhi)細胞内兩(liang)個或多個蛋白質分子通過物理
指兩個或兩個以(yi)上的蛋(dan)⽩質分⼦通過⾮共价键(jian)形(xing)成蛋⽩質复合體的過程。
全(quan)称Foldchange（差异倍(bei)数(shu)）。說明蛋⽩表達變化是(shi)否顯著。
在蛋白質組學分析中，先利用蛋白酶對完(wan)整的蛋白序列(lie)進行酶切處理，將其裂解(jie)成多個较小的肽段片(pian)段，随后(hou)针對酶切后產生的肽段進行逐一鉴定(ding)和分析，因此進入(ru)質谱儀檢測的對象始終是这些肽段而非完(wan)整蛋白，最后根據所(suo)有肽段的序(xu)列信息進行比對和拼接
是指从一個完整的蛋白出(chu)发，在質量分析(xi)儀中進行碎(sui)片化處理，通過對所產生的碎片分子進行逐一檢測，根據碎片序列的質荷比信息推导出原始蛋白
可變修飾是指这種修(xiu)飾不是稳定存在(zai)，不是(shi)所有肽段都存在(zai)的，在(zai)蛋白質翻译后處理(li)過程中，可能是可逆修飾，也可能(neng)化學修飾发生的概率不是100%，导致同一蛋白質分子上(shang)的修飾位點存在
是指所有肽段上都稳定存在的⼀種修飾(shi)，⼀般是添加烷基化修飾，是在樣本製備過程中⼈為(wei)加進去的化學反應，使(shi)所有肽段都发⽣了这個修(xiu)飾。
全(quan)称Peptide-Spectrum matching（匹配到的谱圖数）。指將實际采集到的谱圖與理论(lun)谱圖库進⾏⽐對，当實际(ji)谱圖能匹(pi)配上肽段時，則(ze)記作⼀张PSM。
